在元代，尚有一系以雷默庵为宗师的门派，该派主传混元六天如意大法，门徒甚众，分布西蜀、东南一带。据《历世真仙体道通鉴续续》卷四载：雷时中(1211——1295年)字可权，号默庵。祖籍江西豫章，迁居武昌金牛镇，又号双桥老人。幼习词赋，后通诗经，三领乡荐，精心道学，专务性理。因太平宫知宫点悟，愈留心道法，绝念功名。庚午(1270年)三月三日，玄武诞辰，雷时中具表贺、设坛焚香，朗诵《度人经》。忽有一道人自外至，授以袖中书一卷，令祭坛中，斋戒七日，方可开看。师遵其旨，持诚斋戒七日，拜礼开看其文，乃混元六天如意道法。“看毕，坛中白昼如夜，须臾雷火布满，雷霆辛天君立案上，曰：吾奉昊天敕命，付卿开阐雷霆之教，普济众生。吾教上帝为主，以吾佐之，以卿行之。前日授卿之文者，乃祖师路真君也。卿名在仙籍，七世为儒，三世行法，并无纤过，当大兴吾教。”(18)《道法会元》卷一五四《混元六天妙道一气如意大法》中所述师派首位祖师即为“混元开教大慈普惠路真君大安”，其下依次为混元演教一气妙道雷真人时中、天隐卢真人、九天金阙少宰仙官雷使查真人、天全张真人。该派所主之道法仍为神霄传统，但非常重视《度人经》大乘思想，“专以《度人经》为主，师每化导世人，及开度弟子，皆先令其精心诵经，各获果报。且尝论《度人经》旨，以开后学，其要在十回度人。非惟十遍可以度人，乃在平日修练自己，以究返还之妙。切须先度祖宗，终得道备，飞升上清，经旨之明，莫越是矣。”(19)

雷默庵以道为本，兼及儒学，博采旁求，一贯混融，四方闻其道行卓异，及其门者日众，弟子数千人，因其传播范围，分为二派。西蜀一派以卢真人为首领，东南一派以查真人为宗师。“弟子数千人，分东南、西蜀二派，首度卢、李二宗师及南康查泰宇。由是卢、李之道行于西蜀，泰宇之道行乎东南，混元之教大行于世。所着《心法序要》、《道法直指》、《原道歌》，皆发扬混元道化之妙。”(20)此外，雷默庵又传《负风猛吏辛天君大法》于世。至元乙未(1295年)四月五日逝世，弟子奉葬于郡之颜山，享年八十五。

自张继先兼传雷法之后，从南宋初第三十一代天师张时修，到宋元之交的第三十六代天师张宗演，掌教天师凡七人，多能以精通符咒雷法名世，在当时社会有相当威信。如三十一代天师张时修，“虚靖游四州时，以印剑经录付之，朝英以是。众推之以嗣数”，得以继承法统。三十二代天师张守真，于宋绍兴十年(1140年)袭教。干道元年(1170年)，“毗陵有妖恁树，诏治之，即行，一夕雷拔其树。召赴阙，赐号正应先生。高宗召见，咨问道法。孝宗时江涛冲决，命醮内廷有异应，上赐以象简、宝剑，《清静》、《阴符》二经，赐号正应先生。”三十三代天师张景渊，高宗时尝醮内廷，显大感异。“皇子魏王镇明州，有疾，为坛以请，至乃咒水，饮之而愈。”三十四代天师张庆先，“以嘉泰辛酉(1201年)袭教，性慈俭周贫，因至是经录之传益广。”并留下了劾治张公洞井龙王的故事。三十五代天师张可大，见重于理宗朝。端平(1234—1236年)间，国家多事，可大累次应诏赴阙行斋醮之事，劾治鄱阳湖水灾、钱塘江潮患，“以符投江，雷震殛死大白蛇，水遂复故。”又设醮于太乙宫，禳治蝗灾。嘉熙三年(1239年)，赐号观妙先生，命提举三山符录兼御前诸宫观数门公事，主领杭州龙朔宫。从此，正一派正式成为江南诸派道教的统领。时元世祖忽必烈屯军于武昌，闻其神异，遣密使入龙虎山造访，张可大谓使者曰：“善事尔主，二十年当混一天下。逮至元十三年，果验。”三十六代天师张宗演，亦以道术名世。宋度宗咸淳(1265—1274年)间，江西上饶郡旱灾，守臣唐震请祈雨，灵应如期。入元，世祖至元十三年(1276年)遣使召之，待以客礼。《元史·释老传》曰：“乃见，语之曰：昔岁己未(1259年)，朕次鄂渚，尝令王一清往访卿父，卿父使报朕曰：后二十年天下当混一。神仙之言，验于今焉。因命坐，锡宴，特赐玉芙蓉冠，组金无缝服。命主领江南道教，仍赐银印。”明年(1277年)，又醮于长春宫，“赐号演道灵应冲和真人，给二品银印，命主江南道教事。得自给牒度人为道士。路设道录司，州设道正司，县设威仪司，皆属焉。”元世祖御制曰：“三十六代天师张宗演，卿心传法统，体粹真风，广《黄庭》、《大洞》之科，持正一盟威之录，爰清爰净，以信以诚，三尺青蛇，役鬼神于冥漠；一杯明水，净天孽于迩遐。既弘开济之功，宜畀褒崇之号，特赠演道灵应冲和真人。”(21)

从以上记载，可见元世祖对张宗演礼遇之隆重。尤其需要指出的是，通过这两次接见，张宗演获得“天师”的头衔。在此以前，张陵子孙虽有“天师”的头衔，民间也流行此称呼，但从未被宫方正式承认过。正式用政府名义承认其子孙为天师，则自元世祖始，也只有元代，明太祖即位不久即下诏取消。此外，张宗演又得主领江南道教的职权，这也是史元前例的。之后作为定制，被元代诸帝所沿袭，每代嗣教者都沿制承袭“天师”，“真人”，“主江南道教”如故事，直至元亡。

张宗演作为元代最为著名的南方道教领袖，亦兼传神霄大法。《道法会元》卷一一一至一一三所载《帝令宝珠五雷祈祷大法》，即为张宗演所传。其《序法》曰：“夫宝珠雷法者，玄之又玄，实众法之祖也。世间罕传，自前宋枢密宣使李闲云先生，得传于驾前承应法师集贤院学士朱梅靖先生。后朱入蜀，于青城山羽化之时，止传之三人。一乃新氵金州郭提举，二乃三十六代天师张真人，三乃闲云李先生也。此法行诸天之号令，总三界之雷霆，以先天一气而运用，以后天八卦而成符，名曰宝珠。”“遇之者精勤修炼，行持既久，可以坐役鬼神，可以指挥将吏，可以啸命风雷，可以超凡入圣，非特能保命护身，其实可登真度世。”(22)

白玉蟾一系在元代也有传承，如《洞玄玉枢雷霆大法》即为此系所传。据元成宗元贞丙申(1296年)嗣法弟子薛师淳《事实》记载：白玉蟾得其法于陈泥丸，有泉州马居士之女继其法。至元十八年(1281年)泉州大旱，蒲左丞命僧道祈祷无应，遂请马居士之女设坛建醮，以三日为限，“至三日催符之际，雷风震响，电掣交横，报应非常。”后以道法传翁法建，翁法建“乃丹山翁状元嗣孙也，家寓建宁。至元十六年(1279年)张九万提兵入闽，执拘到泉州，蒲相见其天姿粹美，词翰两优，收置幕下。得法之后，遂回故居，则城郭是而人民非矣。至元二十一年(1284年)建宁大旱，府判梅庵请命祈祷，十分感应。所管建阳县亦旱，县宰申府，府官令其下县祈祷，县宰史嵩之郊迎，立坛于公馆，报应如前。一时嗣法弟子百有余人。江东则有赵菊存，时为建宁儒学教谕，捐车马，竭行囊，北面而师之。”

至元己丑(1289年)，薛师淳浪游闽地，十一月甲子良日，因五福万寿宫道士刘壁峰、连乐山保举监度，得拜翁法建为师，“三载有余，凡士夫请命祈祷，必令相行。余见其平日所用不过九阳、少阳、元阳、真气、熏魔等符，及洞玄九章，以之祈祷治病，如谷应响，观其付与赵菊存、丁松隐文字不同，虽有玄妙处而无纲绪。”至成宗元贞元年(1295年)五月十一日，翁法建召群嗣法弟子曰：“吾欲暂回雷府，雷声响吾即往。俄顷县治之东名曰庵山，峰峦耸峭，雷声隐隐，而翁君羽化矣。群嗣法为请择地，藏剑于北山道院之傍，山水环聚，后之嗣法，必有冲举者焉。师淳坛下嗣法五百余人，今洞玄教之昭著四方，皆翁君主教之灵也。”(23)《法海遣珠》卷一《洞玄秘旨》中所述流派，亦以辛忠义、白玉蟾为祖师，其下宗师为“紫霞扶风洞玄元明君马士清、洞玄通明中侍卿翁法建、洞玄元明崇侍卿薛师淳。”(24)由此可见此系于元初兴盛一时，门徒甚多。

在张宇初《岘泉集》中所说的神霄派宗师中，有一位叫做邓铁崖的，亦是元代的一名高道。《道藏》中所收《道法宗旨图衍义》二卷，题“铁崖邓木冉以正纂图”，“养吾章希贤亮衍义”。章希贤为元成宗、武宗年间人，籍贯江西临川。字师亮，号养吾子。通儒、释、道三教之说，与三十八代天师广微子、临川道士空玄子汪万顷等交游。邓木冉号铁崖子，生平不详，亦当为章希贤至友。章希贤曰：“铁崖子伤大道之不行，悯流俗之傍见，纂集诸象，为《道法宗旨图》。噫，大哉其心也。龙虎刊行，观之若望洋焉。希贤不愧凡愚，尝有志于三家微言，为之衍义。”(25)

此书中收有“元始祖劫图”、“混元化身图”、“雷霆互用图”、“雷霆之图”、“雷霆三关图”、“五雷攒簇图”、“雷霆吞啖图”、“将用自己元神图”、“五雷胎息图”、“雷霆一窍图”、“雷霆九宫图”、“雷霆运用图”、“雷霆玄化图”等二十二图，以阴阳五行、九宫八卦等原理，用图文阐述天尊化身、日月运行、四季变化、役使雷霆的理论及法诀，阐明神霄雷法之原理，每图后为“衍义”，大都征引道、儒、释三家有关语录，主以阴阳变化之原理，天人感应的思想，解释风雨雷霆之形成，为元代的一部重要雷法著作。

如此众多的神霄派高道，活跃于元代，出入朝野，济世度人，并留下了许多宝贵的著述，不仅将神霄一脉下传后代，亦为今人研修神霄大道提供了一份珍贵的史料。